204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1049 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  100 
 
 
222 aa  460  1e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  60.47 
 
 
210 aa  275  3e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  60.47 
 
 
210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  58.6 
 
 
212 aa  268  5e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  60.47 
 
 
210 aa  268  5e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  39.46 
 
 
241 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  36.73 
 
 
239 aa  154  7e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  37.22 
 
 
244 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  37.73 
 
 
241 aa  151  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  35.85 
 
 
217 aa  123  2e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  37.95 
 
 
217 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  32.12 
 
 
215 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  26.67 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  27.54 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  29.93 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  25.94 
 
 
497 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  30.89 
 
 
342 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  29.5 
 
 
354 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  31.11 
 
 
283 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  27.83 
 
 
508 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  26.84 
 
 
295 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  31.97 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  26.29 
 
 
497 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1303  deoxyuridylate hydroxymethyltransferase, putative  28.46 
 
 
329 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  28.7 
 
 
325 aa  58.2  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0064  putative thymidylate synthase protein  26.83 
 
 
329 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  27.48 
 
 
277 aa  57.8  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1563  putative thymidylate synthase  26.83 
 
 
329 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1475  putative thymidylate synthase  26.83 
 
 
329 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.190505  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  26.8 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  26.8 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  27.1 
 
 
326 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  30.51 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  30.23 
 
 
290 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  26.29 
 
 
217 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2432  thymidylate synthase  27.97 
 
 
279 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  32.74 
 
 
508 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2987  thymidylate synthase  27.13 
 
 
342 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  25.79 
 
 
265 aa  55.1  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5043  thymidylate synthase  31.01 
 
 
277 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182015  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  24.88 
 
 
264 aa  55.1  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  29.25 
 
 
512 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  28.81 
 
 
274 aa  54.7  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  28.83 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  30 
 
 
300 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  28 
 
 
280 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  28 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  27.78 
 
 
264 aa  53.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  30.07 
 
 
267 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  26.83 
 
 
271 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  26.19 
 
 
264 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  32.23 
 
 
264 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  24.8 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  25.81 
 
 
264 aa  52.8  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  26.83 
 
 
320 aa  52.8  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  27.2 
 
 
264 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  30.33 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  28.28 
 
 
285 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  29.01 
 
 
276 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1454  thymidylate synthase  27.41 
 
 
335 aa  52  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  27.27 
 
 
277 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  27.87 
 
 
264 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  27.05 
 
 
265 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  30.33 
 
 
264 aa  52  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  25.4 
 
 
264 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  26.27 
 
 
277 aa  51.6  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  25.45 
 
 
499 aa  51.6  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  28.1 
 
 
267 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  29.51 
 
 
272 aa  51.2  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  27.78 
 
 
264 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  27.78 
 
 
264 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  26.19 
 
 
264 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1682  thymidylate synthase  26.36 
 
 
338 aa  51.2  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  25.78 
 
 
290 aa  51.2  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  27.64 
 
 
268 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  27.78 
 
 
318 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  26.36 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  26.36 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  27.05 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  25.89 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  25.93 
 
 
318 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  26.61 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  25.12 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  27.83 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  23.21 
 
 
275 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  26.23 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  27.87 
 
 
264 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  25.45 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  25.45 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  28.07 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  25 
 
 
267 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  25.93 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  25.93 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  25.93 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  26.05 
 
 
290 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  25.93 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  25.93 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  25.93 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  27.05 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  27.03 
 
 
264 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>