266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0710 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  100 
 
 		 215 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  58.29 
 
 		 217 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  59.05 
 
 		 217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  32.85 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  32.02 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  34.63 
 
 		 460 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  31.88 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 212 aa  104  9e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  31.22 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  32.12 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  32.51 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  31.94 
 
 		 512 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  32.58 
 
 		 497 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  30.54 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  30.32 
 
 		 497 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  29.63 
 
 		 508 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  28.51 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  38.79 
 
 		 285 aa  75.5  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  31.86 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  28.77 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  28.3 
 
 		 217 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  29.46 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  27.83 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  32.26 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  26.82 
 
 		 347 aa  72  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  30.77 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  31.62 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  30.4 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  31.01 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  30.77 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  28.68 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  29.6 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  29.91 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  30.65 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  29.6 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  30.65 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  27.4 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  28.57 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  30.51 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  29.91 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  28.48 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  28.68 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  28 
 
 		 499 aa  65.1  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  28.68 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  28.21 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  28.35 
 
 		 322 aa  65.1  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  27.42 
 
 		 320 aa  64.7  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  29.1 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  29.27 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  29.27 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  27.91 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  29.46 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  26.98 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  28.17 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  27.91 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  29.03 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  28.03 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  30.77 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  27.87 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3006  thymidylate synthase  32.69 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  27.97 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  27.87 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  27.42 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  29.06 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  28.03 
 
 		 267 aa  62  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  27.91 
 
 		 264 aa  62  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  28.68 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  29.84 
 
 		 267 aa  62  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  30.25 
 
 		 275 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  26.52 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  29.51 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0805  hypothetical protein  25.85 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  22.52 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  29.91 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  22.52 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  29.91 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  29.46 
 
 		 283 aa  61.6  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  24.5 
 
 		 318 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 290 aa  61.2  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  29.84 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  29.84 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  28.69 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>