233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0815 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  63.39 
 
 
497 aa  659    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  100 
 
 
508 aa  1049    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  67.41 
 
 
508 aa  701    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  60.24 
 
 
512 aa  656    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  62.58 
 
 
497 aa  620  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  30.27 
 
 
460 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  30.88 
 
 
217 aa  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  31.22 
 
 
217 aa  106  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  28.51 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  25.93 
 
 
217 aa  77  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  25.93 
 
 
217 aa  77  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  26.73 
 
 
217 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  34.15 
 
 
268 aa  69.7  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  28 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  26.19 
 
 
210 aa  67  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  26.67 
 
 
210 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  38.05 
 
 
285 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  26.09 
 
 
210 aa  65.1  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  26.7 
 
 
264 aa  63.9  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  33.09 
 
 
260 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  35.98 
 
 
277 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  32.93 
 
 
264 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  23.87 
 
 
212 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  27.44 
 
 
267 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1315  thymidylate synthase  33.79 
 
 
279 aa  61.6  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.667766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  32 
 
 
264 aa  61.6  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  32.64 
 
 
271 aa  61.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  31.93 
 
 
264 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  28.4 
 
 
264 aa  60.5  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  30.77 
 
 
264 aa  60.5  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  27.78 
 
 
318 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  30.71 
 
 
244 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  32.89 
 
 
264 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0622  thymidylate synthase  30.73 
 
 
286 aa  59.7  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  28.5 
 
 
264 aa  59.3  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  29.82 
 
 
264 aa  58.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  30.23 
 
 
318 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  26.83 
 
 
267 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  28.5 
 
 
264 aa  59.3  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  29.94 
 
 
264 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  30.13 
 
 
278 aa  58.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  29.33 
 
 
318 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  30.94 
 
 
273 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  29.33 
 
 
318 aa  58.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2712  dihydropteroate synthase DHPS  41.11 
 
 
471 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  28.19 
 
 
241 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  26.46 
 
 
318 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  33.6 
 
 
265 aa  57  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  32.37 
 
 
275 aa  57.4  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  27.47 
 
 
264 aa  57  0.0000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  27.78 
 
 
264 aa  57  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  32.85 
 
 
264 aa  57  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  32.24 
 
 
264 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  28.67 
 
 
272 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  28.83 
 
 
264 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  29.88 
 
 
267 aa  56.6  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2047  thymidylate synthase  30.57 
 
 
264 aa  56.6  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  29.7 
 
 
264 aa  56.2  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  32.41 
 
 
264 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  28.33 
 
 
325 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  31.47 
 
 
263 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  30.82 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  32.74 
 
 
222 aa  55.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  27.33 
 
 
241 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  27.49 
 
 
264 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  30.92 
 
 
264 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  29.76 
 
 
264 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  29.45 
 
 
264 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  28.47 
 
 
264 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  29.45 
 
 
264 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  26.83 
 
 
264 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  30.94 
 
 
283 aa  54.7  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  28.57 
 
 
290 aa  54.3  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0351  hypothetical protein  36.79 
 
 
134 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1188  AP-4-A phosphorylase II-like protein  37.14 
 
 
130 aa  54.3  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.13202  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  28.92 
 
 
265 aa  54.3  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  30.28 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  30.28 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  30.37 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  27.22 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  32.52 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  27.81 
 
 
264 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  27.81 
 
 
274 aa  53.9  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3014  thymidylate synthase  28.57 
 
 
264 aa  54.3  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  30.46 
 
 
264 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  28.24 
 
 
296 aa  53.9  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  29.85 
 
 
280 aa  53.9  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1030  thymidylate synthase  32.26 
 
 
266 aa  53.9  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0805  hypothetical protein  25.84 
 
 
238 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01741  hypothetical protein  34.29 
 
 
133 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134787  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  30.66 
 
 
264 aa  53.5  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>