223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0624 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  95.24 
 
 		 210 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  92.38 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  80.95 
 
 		 212 aa  358  4e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  60.47 
 
 		 222 aa  268  5e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  40 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  40.47 
 
 		 241 aa  168  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  36.74 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  37.85 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  36.06 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  34.52 
 
 		 217 aa  118  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  31.88 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  29.77 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  28.71 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  30.98 
 
 		 512 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  36.61 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  32.39 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  25.13 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  28.42 
 
 		 325 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  26.82 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  26.09 
 
 		 508 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  28.03 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  28.03 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  26.36 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  25.7 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  25.7 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  24.02 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  30.83 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  26.56 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  31.58 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  30.5 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  26.57 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  25.42 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  32 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  25.7 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  33 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  25.14 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  30 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  25.7 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  22.92 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  23.96 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  25.52 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  31.67 
 
 		 367 aa  58.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  26.82 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  28.49 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2432  thymidylate synthase  21.95 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  26.26 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  25.14 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  25.14 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  30.22 
 
 		 347 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  24.02 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  22.91 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  23.44 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  24.58 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  25.52 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  24.02 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  29 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  26.78 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  25.82 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  23.89 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1454  thymidylate synthase  31.58 
 
 		 335 aa  55.1  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  24.44 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  25 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  24.02 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  27.21 
 
 		 276 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  26 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  25.85 
 
 		 274 aa  54.7  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  23.44 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  22.4 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0064  putative thymidylate synthase protein  25.95 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  24.58 
 
 		 264 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  30 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  23.46 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  23.46 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1563  putative thymidylate synthase  25.95 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1475  putative thymidylate synthase  25.95 
 
 		 329 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.190505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  24.58 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5043  thymidylate synthase  26.56 
 
 		 277 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1609  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 289 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.536162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  23.96 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  26.06 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  24.02 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1303  deoxyuridylate hydroxymethyltransferase, putative  26.49 
 
 		 329 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  25.14 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  29 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  29 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  28 
 
 		 499 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>