27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1795 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  100 
 
 		 285 aa  594  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  35.77 
 
 		 239 aa  136  4e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  35.34 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  34.28 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  32.47 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  38.46 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  37.17 
 
 		 460 aa  82  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  28.41 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  27.86 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  27.14 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  25.56 
 
 		 217 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  29.77 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  38.79 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  26.67 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  40.32 
 
 		 508 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  40.54 
 
 		 512 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  38.05 
 
 		 508 aa  65.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  28.44 
 
 		 497 aa  65.5  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  39.29 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl419  thymidylate synthase  31.97 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0183487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  30.58 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0846  thymidylate synthase  34.69 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  30.3 
 
 		 290 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  34.69 
 
 		 298 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0390  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.137762  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  30.93 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 260 aa  42.7  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>