210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0549 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  100 
 
 		 241 aa  501  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  67.63 
 
 		 241 aa  361  7.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  65.69 
 
 		 244 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  61.34 
 
 		 239 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  36.74 
 
 		 210 aa  162  6e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  35.81 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  35.35 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  35.48 
 
 		 212 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  37.73 
 
 		 222 aa  151  1e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  34.31 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  31.19 
 
 		 217 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  32.47 
 
 		 285 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  32.51 
 
 		 215 aa  100  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  34.17 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  26.19 
 
 		 512 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  29.13 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  32.35 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 318 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 318 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  26.03 
 
 		 318 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  26.03 
 
 		 318 aa  62  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  32.35 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1454  thymidylate synthase  29.03 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  32.35 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  35.96 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  25.41 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  26.06 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  29.82 
 
 		 283 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  31.37 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  25 
 
 		 322 aa  58.9  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  28.23 
 
 		 367 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  29.52 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  26.06 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  26.06 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  30.46 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  26.06 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  30.1 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  30.97 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  25.35 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  25.35 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  25.35 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  25.35 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  28.83 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  25.35 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  30.69 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  30.84 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  24.65 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  27.33 
 
 		 508 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 508 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  29.52 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  30.84 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  29.52 
 
 		 285 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0805  hypothetical protein  31.75 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  25.12 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  25.12 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  25.12 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  27.59 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  27.72 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  26.95 
 
 		 326 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  28.71 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 264 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  29.82 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 278 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  30.7 
 
 		 274 aa  52.4  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  27.72 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  29.51 
 
 		 499 aa  52.4  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  28.71 
 
 		 264 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  28.28 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 264 aa  52  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  26.72 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 290 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  27.78 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  26.73 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  27.72 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  27.59 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 267 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3946  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  27.69 
 
 		 497 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  27.93 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>