23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0805 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0805  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  26.34 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  29.3 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  25.37 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  26.48 
 
 		 215 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  26.47 
 
 		 342 aa  58.5  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  23.42 
 
 		 508 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  29.94 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  31.75 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  25.86 
 
 		 508 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  23.47 
 
 		 512 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  29.23 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  33.33 
 
 		 244 aa  52  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 497 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  26.11 
 
 		 497 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  28.93 
 
 		 367 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  25.6 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  29.41 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  29.73 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  26.79 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  27.54 
 
 		 354 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  26.98 
 
 		 210 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  27.88 
 
 		 263 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>