232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0109 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  63.6 
 
 		 241 aa  326  2.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  61.34 
 
 		 241 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  57.56 
 
 		 244 aa  298  5e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  38.79 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  36.73 
 
 		 222 aa  154  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  37.85 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  38.32 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  37.38 
 
 		 210 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  36.95 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  35.77 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  33.99 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  32.02 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  29.86 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  28.12 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  28.12 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  28.65 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  28.12 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  27.6 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  27.6 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  27.6 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  27.6 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  27.6 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  27.08 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  28.11 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  28 
 
 		 508 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  27.65 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  31.86 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  31.86 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  28.19 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  34 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  28.19 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  27.98 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  32.12 
 
 		 354 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 320 aa  67  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  34.29 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  35.92 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  27.41 
 
 		 512 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  33 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2166  thymidylate synthase  34.19 
 
 		 342 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2987  thymidylate synthase  33.6 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  32.17 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  25.87 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  32.46 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  30.3 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  33.63 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3006  thymidylate synthase  33 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  33 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1475  putative thymidylate synthase  33.9 
 
 		 329 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.190505  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0064  putative thymidylate synthase protein  33.9 
 
 		 329 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  33.63 
 
 		 268 aa  62  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1563  putative thymidylate synthase  33.9 
 
 		 329 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  32 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  34 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  32.74 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  30.97 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1682  thymidylate synthase  33.04 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  25.81 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  27.97 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  30.97 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  33 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  24.2 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  32.17 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  30.43 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  32 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  32 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  25.87 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  31.43 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  30.09 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  32.35 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  31.37 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  31 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  22.71 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3946  thymidylate synthase  33.63 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  31.86 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  30.97 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  24.04 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  31 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  29.57 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  30.97 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  26.04 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  30.43 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  31 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  29.06 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  32 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1303  deoxyuridylate hydroxymethyltransferase, putative  31.03 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  24.04 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  31.43 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  28.7 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  30.97 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  31 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  33 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  23.74 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2432  thymidylate synthase  31.4 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  29.57 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  29.57 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  27.98 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>