22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1327 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  100 
 
 		 295 aa  622  1e-177  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  29.86 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  31.67 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  29 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  26.89 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  33.61 
 
 		 460 aa  65.5  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  29.13 
 
 		 241 aa  65.5  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  25.93 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  26.14 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  26.36 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  26.84 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  29.38 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  26.88 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  32.05 
 
 		 512 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  28.66 
 
 		 508 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  32.2 
 
 		 497 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  33.9 
 
 		 508 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  30.58 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  26.47 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  30.43 
 
 		 497 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  29.95 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>