60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1745 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  42.41 
 
 		 217 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  42.02 
 
 		 217 aa  195  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  42.41 
 
 		 217 aa  193  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  26.42 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  25 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  27.97 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  23.62 
 
 		 497 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  23.72 
 
 		 508 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  22.05 
 
 		 512 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  24.9 
 
 		 508 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  27.83 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  24.39 
 
 		 215 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  28.7 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  25.47 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  28.99 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  32.28 
 
 		 354 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  32.69 
 
 		 266 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  31.25 
 
 		 326 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1682  thymidylate synthase  27.48 
 
 		 338 aa  46.2  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  25.21 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  29.95 
 
 		 295 aa  45.4  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  28.7 
 
 		 222 aa  45.8  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  32.41 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  29.75 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3946  thymidylate synthase  27.85 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  28.43 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  21.26 
 
 		 497 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1977  thymidylate synthase  27.93 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  32.11 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  26.5 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  28.85 
 
 		 272 aa  43.9  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  27.5 
 
 		 460 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  30.09 
 
 		 318 aa  43.5  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  27.12 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  26.79 
 
 		 264 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  29.81 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  30.1 
 
 		 264 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2380  thymidylate synthase  30.77 
 
 		 266 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  27.88 
 
 		 267 aa  43.1  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  28.81 
 
 		 277 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1609  thymidylate synthase  27.35 
 
 		 289 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.536162  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2987  thymidylate synthase  26.19 
 
 		 342 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  26.85 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  28.85 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  25.95 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  29.82 
 
 		 264 aa  42.7  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  27.45 
 
 		 318 aa  42.4  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  28.33 
 
 		 264 aa  42.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  30.53 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  26.72 
 
 		 320 aa  42.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  31.2 
 
 		 347 aa  42.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  28.85 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  28.85 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  28.85 
 
 		 266 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  29.46 
 
 		 286 aa  42.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  29.77 
 
 		 325 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>