270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0890 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  78.57 
 
 		 217 aa  366  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  59.05 
 
 		 215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  36.95 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  36.59 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  34.31 
 
 		 241 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  36.04 
 
 		 210 aa  124  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  34.34 
 
 		 212 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  37.95 
 
 		 222 aa  122  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  34.31 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  34.52 
 
 		 210 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  34.52 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  31.94 
 
 		 512 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  30.88 
 
 		 508 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  29.77 
 
 		 460 aa  107  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  30.45 
 
 		 497 aa  101  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  29.86 
 
 		 508 aa  94.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  31.05 
 
 		 497 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  29.95 
 
 		 217 aa  91.3  9e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  30.41 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  29.95 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  38.46 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  32.03 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  30.97 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0805  hypothetical protein  26.34 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  32.8 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  31.25 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  33.6 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  25 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  35.54 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  32.52 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  30.53 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  31.01 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  31.01 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  30.23 
 
 		 325 aa  67  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  26.49 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  26.49 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  31.01 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  32.54 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  30.23 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  30.95 
 
 		 367 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  31.4 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  28.91 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  30.4 
 
 		 499 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  26.37 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  26.37 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  31.62 
 
 		 265 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  32.03 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  31.01 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  31.25 
 
 		 267 aa  65.1  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  30.23 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  29.8 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  30.08 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  30.08 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  32.23 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  31.4 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  33.06 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  29.75 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  28.78 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  30.08 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  29.75 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  29.06 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  25 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  34.19 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  28.48 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  29.14 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  29.14 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3946  thymidylate synthase  30.89 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  30.08 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  29.14 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  29.14 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  31.4 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  29.14 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  32.23 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  29.5 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  28.48 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  29.77 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3006  thymidylate synthase  30.63 
 
 		 334 aa  62.8  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  30 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  29.03 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  31.45 
 
 		 318 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  31.4 
 
 		 264 aa  62  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  30.51 
 
 		 278 aa  62  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  29.91 
 
 		 264 aa  62  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  29.92 
 
 		 290 aa  62  0.000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  27.81 
 
 		 318 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  29.23 
 
 		 274 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  29.92 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  28.48 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  30.6 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>