230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0199 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  93.33 
 
 		 210 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  92.38 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  77.14 
 
 		 212 aa  348  3e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  60.47 
 
 		 222 aa  275  3e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  40 
 
 		 244 aa  167  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  39.07 
 
 		 241 aa  161  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  35.35 
 
 		 241 aa  156  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  37.38 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  35.58 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  36.04 
 
 		 217 aa  124  9e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  29.13 
 
 		 460 aa  88.6  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  27.86 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 512 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 497 aa  75.9  0.0000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  35.71 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  26.19 
 
 		 508 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  34 
 
 		 300 aa  64.7  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  24.88 
 
 		 497 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  34.17 
 
 		 264 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  29.27 
 
 		 354 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  25.93 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  32.43 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  31.03 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  35 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  25.36 
 
 		 508 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5043  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 277 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.182015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  30.47 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  30.47 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  30.08 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  30.99 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0381  thymidylate synthase  28 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  29.08 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2432  thymidylate synthase  25.31 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  29.75 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  31 
 
 		 320 aa  58.9  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  30.69 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  30.83 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  31 
 
 		 286 aa  58.9  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0387  thymidylate synthase  27.46 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.610342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  29.17 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  28.93 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  30.33 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  25.41 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  29.66 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  32.67 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  32.35 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  30.58 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1303  deoxyuridylate hydroxymethyltransferase, putative  24.61 
 
 		 329 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.616091  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  28.17 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  31.67 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  31.67 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  32.38 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  32.38 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  32.38 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  29.17 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  26.76 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  28.69 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3006  thymidylate synthase  29.31 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  30.08 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  31.58 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  29.7 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  22.87 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  27.47 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>