250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1079 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  78.57 
 
 		 217 aa  366  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  58.29 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  35.41 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  33.99 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  35.58 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  35.58 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  36.06 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  35.85 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 241 aa  117  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  31.19 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  28.64 
 
 		 460 aa  108  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  31.37 
 
 		 244 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  33.33 
 
 		 512 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  31.22 
 
 		 508 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  32.26 
 
 		 497 aa  101  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  32.26 
 
 		 508 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  31.36 
 
 		 497 aa  94.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  31.02 
 
 		 217 aa  91.7  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  31.02 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  30.56 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1795  thymidylate synthase-like  25.56 
 
 		 285 aa  78.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  26.42 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  23.87 
 
 		 347 aa  68.6  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  31.3 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  31.54 
 
 		 325 aa  65.1  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  28.32 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  27.34 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  26.92 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0782  thymidylate synthase  30.95 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.412058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0805  hypothetical protein  25.37 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  31.82 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  25.95 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  25.95 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  27.56 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  29.23 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2987  thymidylate synthase  28.48 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.177483  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  28.93 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  28.35 
 
 		 264 aa  59.3  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  26.15 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  26.54 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  26.54 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1327  thymidylate synthase-like protein  29.38 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  28.91 
 
 		 267 aa  58.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  27.78 
 
 		 499 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  26.52 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  25 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  27.07 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  25.38 
 
 		 342 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  27.56 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  25.18 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3946  thymidylate synthase  28 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  27.13 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  26.36 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  28.35 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  26.15 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3006  thymidylate synthase  30.63 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  24.24 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  26.49 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  28.93 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  26.77 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  28 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  26.77 
 
 		 264 aa  55.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  27.21 
 
 		 276 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  27.05 
 
 		 264 aa  54.7  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  26.49 
 
 		 318 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  28.35 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  27.64 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1682  thymidylate synthase  29.25 
 
 		 338 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  28.35 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  27.54 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  26.45 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  27.35 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  25.76 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  25.2 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  23.62 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  25.83 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  25.83 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  25.83 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  28.1 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  25.83 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  27.69 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  28.93 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_1690  predicted protein  27.07 
 
 		 495 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  26.77 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  26.62 
 
 		 322 aa  53.5  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  27.78 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  25.83 
 
 		 318 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  25.17 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  25.17 
 
 		 318 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  27.27 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4970  thymidylate synthase  25.58 
 
 		 274 aa  53.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>