129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0819 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0819  thymidylate synthase, putative  100 
 
 		 217 aa  454  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_723  thymidylate synthase  97.22 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0738  thymidylate synthase-like protein  96.76 
 
 		 217 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.912305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1745  thymidylate synthase-like protein  42.41 
 
 		 263 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0307935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0890  thymidylate synthase  30.41 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1079  thymidylate synthase  31.02 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0815  thymidylate synthase  26.73 
 
 		 508 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.148226 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0710  thymidylate synthase  28.77 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5011  thymidylate synthase  26.36 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1245  thymidylate synthase  26.76 
 
 		 497 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0109  hypothetical protein  27.98 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0726  thymidylate synthase  25 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1276  thymidylate synthase  25.93 
 
 		 508 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0565083 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1003  thymidylate synthase  32.11 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1582  thymidylate synthase  32.11 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  30.08 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1049  thymidylate synthase  26.29 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1545  thymidylate synthase  29.5 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2266  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0871479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2082  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314247  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2020  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2020  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2236  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.376946  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0404  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 290 aa  54.7  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3787  thymidylate synthase  30.3 
 
 		 308 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  32.67 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2061  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2348  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000465459  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2219  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.615313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2263  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45604e-29 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0549  thymidylate synthase  25.12 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000344627  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0769  thymidylate synthase  32 
 
 		 320 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0319  thymidylate synthase  26.42 
 
 		 325 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3105  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 318 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447667  hitchhiker  0.0000000000170345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0076  thymidylate synthase, methanogen type  24.07 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.527741 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2728  thymidylate synthase  28 
 
 		 260 aa  52.8  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2834  thymidylate synthase  31.68 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2001  thymidylate synthase  29.21 
 
 		 367 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.745525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1760  thymidylate synthase  29.25 
 
 		 265 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  30.19 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1639  thymidylate synthase  31 
 
 		 318 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00770076  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  29.84 
 
 		 318 aa  51.6  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  29 
 
 		 267 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 277 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1487  thymidylate synthase  29.36 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1516  thymidylate synthase  29.36 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  30.7 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4706  thymidylate synthase  27.16 
 
 		 326 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  32.71 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  28.97 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  28.95 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0199  thymidylate synthase  23.33 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.732391  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  37.97 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2176  thymidylate synthase  33.03 
 
 		 270 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.160989  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  28.95 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  28 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  28.95 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  31 
 
 		 264 aa  49.7  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0458  thymidylate synthase  31.58 
 
 		 322 aa  49.7  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2380  thymidylate synthase  38.81 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  38.81 
 
 		 266 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  33.01 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0948  thymidylate synthase-like  22.32 
 
 		 460 aa  48.9  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  33.01 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  33.01 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  34.85 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  31.13 
 
 		 276 aa  48.5  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  30 
 
 		 264 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  30 
 
 		 264 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3946  thymidylate synthase  28.3 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1063  thymidylate synthase  25.25 
 
 		 347 aa  47.8  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2314  thymidylate synthase  33 
 
 		 290 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  26.32 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2047  thymidylate synthase  34.62 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  30 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0689  thymidylate synthase  25.14 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0624  thymidylate synthase  32.98 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0521  thymidylate synthase  36.23 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.700013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1294  thymidylate synthase  22.93 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.368464  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29370  thymidylate synthase  28.71 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0214  thymidylate synthase  33.82 
 
 		 354 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  28.44 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  29.7 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  28.7 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  29 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  30 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2331  thymidylate synthase  29.63 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  30 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  28.95 
 
 		 283 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1789  thymidylate synthase  27.72 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.748216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  29 
 
 		 264 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  28.7 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0234  thymidylate synthase  27.36 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49676  predicted protein  28 
 
 		 499 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.21688 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  29 
 
 		 264 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  28 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  27.78 
 
 		 264 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2011  thymidylate synthase  32 
 
 		 300 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  29 
 
 		 264 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1475  putative thymidylate synthase  29.41 
 
 		 329 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.190505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>