261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1315 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1315  thymidylate synthase  100 
 
 		 279 aa  584  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.667766  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0622  thymidylate synthase  82.52 
 
 		 286 aa  496  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1631  thymidylate synthase  76.79 
 
 		 279 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0632  thymidylate synthase  34.27 
 
 		 282 aa  152  4e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1227  thymidylate synthase  35.66 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.101938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0188  thymidylate synthase  33.81 
 
 		 276 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  32.96 
 
 		 283 aa  118  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  30.71 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  30 
 
 		 264 aa  118  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  34.15 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  29.29 
 
 		 264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  32.81 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  33.88 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  31.15 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  29.29 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  33.21 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  28.21 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  30.43 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  30.68 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  31.75 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  30.83 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  31.23 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  31.23 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  32.5 
 
 		 285 aa  109  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  31.12 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  30.42 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  31.23 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  29.29 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  31.75 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  29.29 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  27.86 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  31.62 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  29.92 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  30.83 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  29.43 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  32.41 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  30.43 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  29.29 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  30.48 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 296 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  31.23 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  28.69 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  28.93 
 
 		 264 aa  105  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2032  Thymidylate synthase  31.47 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00060457  hitchhiker  0.0000668058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  30.07 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  30.62 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  29.66 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  29.88 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  30.16 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  30.45 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  30.16 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  28.21 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  28.21 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  30.16 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  29.55 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2380  thymidylate synthase  30.71 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.029199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0340  thymidylate synthase  30.86 
 
 		 283 aa  102  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4922  Thymidylate synthase  29.52 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  29.44 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  26.79 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  28.83 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  28.83 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  28.46 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12777  thymidylate synthase  31.35 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.470596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  29.92 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  29.92 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  27.65 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  30.86 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  31.89 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  29.37 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  29.43 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  30.65 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  28.93 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4007  thymidylate synthase  31.35 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211563  normal  0.0387456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 264 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  29.29 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  30.32 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  28.87 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  30.32 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  28.85 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  30.32 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  30.32 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  27.08 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  30.32 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  28.57 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  29.18 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  99.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  29.48 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  27.5 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5812  thymidylate synthase  28.32 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.454051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23310  thymidylate synthase  27.34 
 
 		 271 aa  99  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245903  normal  0.0233829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  30.89 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>