261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0622 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0622  thymidylate synthase  100 
 
 		 286 aa  598  1e-170  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1315  thymidylate synthase  82.52 
 
 		 279 aa  496  1e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.667766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1631  thymidylate synthase  74.56 
 
 		 279 aa  442  1e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1227  thymidylate synthase  38.14 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.101938  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0632  thymidylate synthase  35.79 
 
 		 282 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0188  thymidylate synthase  34.98 
 
 		 276 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  32.73 
 
 		 283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2032  Thymidylate synthase  32.71 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00060457  hitchhiker  0.0000668058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  31.83 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  30.39 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  33.07 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  32.45 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  32.54 
 
 		 264 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  32.45 
 
 		 264 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1527  thymidylate synthase  30.69 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  30.3 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  30.19 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  31.54 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  29.33 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  32.58 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  32.05 
 
 		 264 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  28.98 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  28.98 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  28.98 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  29.33 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0390  thymidylate synthase  28.52 
 
 		 298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.137762  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  32.12 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0907  thymidylate synthase  31.1 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.639895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  32.58 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  30.14 
 
 		 264 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  32.35 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  32.2 
 
 		 264 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  108  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2044  thymidylate synthase  28.87 
 
 		 298 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3396  thymidylate synthase  31.1 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0862662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  31.72 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  31 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  29.27 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0947  thymidylate synthase  31.66 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.014257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  29.68 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  30.82 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  32.2 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  29.93 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0442  thymidylate synthase  30.3 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  31.06 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1731  thymidylate synthase  30.3 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  31.1 
 
 		 285 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0846  thymidylate synthase  29.58 
 
 		 298 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  30.94 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  29.43 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  30.15 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  30.45 
 
 		 264 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  28.33 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  29.43 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  32.21 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2099  thymidylate synthase  31.84 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.121978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2112  thymidylate synthase  31.84 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.343754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  30.21 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  31.36 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2158  thymidylate synthase  31.84 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.46216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  29.96 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  29.75 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  29.08 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  31.32 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3148  thymidylate synthase  29.97 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0340  thymidylate synthase  28.9 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3165  thymidylate synthase  29.97 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.623255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  29.89 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3328  thymidylate synthase  29.97 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3228  thymidylate synthase  29.97 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3214  thymidylate synthase  29.97 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0238211 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  30.32 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  30.11 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  31.46 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  30.57 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4439  Thymidylate synthase  29.79 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.613573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  30.31 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0830  thymidylate synthase  28.79 
 
 		 318 aa  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0147447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  31.66 
 
 		 280 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2047  thymidylate synthase  28.9 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412678  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  29.24 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  29.68 
 
 		 264 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0818  thymidylate synthase  30.89 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3821  thymidylate synthase  30.04 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0782248  normal  0.435378 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  31.06 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  28.37 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3018  thymidylate synthase  30.38 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0786237  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2864  thymidylate synthase  27.82 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.292477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  30.66 
 
 		 264 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3172  thymidylate synthase  29.1 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374556  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>