259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2032 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_2032  Thymidylate synthase  100 
 
 		 271 aa  563  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00060457  hitchhiker  0.0000668058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1751  thymidylate synthase  69.37 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0575891  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2021  thymidylate synthase  68.63 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2802  thymidylate synthase  68.27 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395384  normal  0.702269 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2822  thymidylate synthase  69 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0100579  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2543  thymidylate synthase  67.16 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.33393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1289  thymidylate synthase  65.31 
 
 		 264 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.994913  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4213  thymidylate synthase  67.9 
 
 		 264 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1422  thymidylate synthase  66.05 
 
 		 264 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.54015 
 
 
-
 
NC_004310  BR1399  thymidylate synthase  67.16 
 
 		 264 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0593  thymidylate synthase  66.05 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.931359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3385  thymidylate synthase  66.67 
 
 		 283 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2040  thymidylate synthase  67.16 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00561284  normal  0.510775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2351  thymidylate synthase  66.79 
 
 		 264 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.914614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1355  thymidylate synthase  66.79 
 
 		 264 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0892428  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4007  thymidylate synthase  65.68 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.997554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1962  thymidylate synthase  64.58 
 
 		 264 aa  364  1e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04480  thymidylate synthase  67.16 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0926  thymidylate synthase  64.21 
 
 		 264 aa  363  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3266  thymidylate synthase  65.68 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394281  normal  0.266288 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1792  thymidylate synthase  66.79 
 
 		 264 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3354  thymidylate synthase  65.31 
 
 		 264 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0436  thymidylate synthase  66.79 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595283  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6453  thymidylate synthase  63.47 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.297747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2730  thymidylate synthase  64.58 
 
 		 264 aa  360  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6100  thymidylate synthase  64.21 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.50271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09380  thymidylate synthase  64.21 
 
 		 264 aa  358  3e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21237  normal  0.43537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1592  thymidylate synthase  64.21 
 
 		 264 aa  359  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00136284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2036  thymidylate synthase  65.31 
 
 		 264 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0350  thymidylate synthase  62.32 
 
 		 277 aa  357  8e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.82099  normal  0.227002 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2027  thymidylate synthase  63.81 
 
 		 285 aa  357  9e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.242999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48170  thymidylate synthase  64.58 
 
 		 264 aa  356  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1309  thymidylate synthase  61.25 
 
 		 264 aa  355  3.9999999999999996e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00097821  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2448  thymidylate synthase  63.47 
 
 		 264 aa  354  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.848435  normal  0.156064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3514  thymidylate synthase  63.47 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.34042  normal  0.150585 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2572  thymidylate synthase  64.21 
 
 		 264 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.31562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2311  thymidylate synthase  61.9 
 
 		 273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2812  thymidylate synthase  63.1 
 
 		 264 aa  352  5e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000021691  hitchhiker  0.0000331365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0906  thymidylate synthase  62.73 
 
 		 264 aa  352  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1050  thymidylate synthase  62.73 
 
 		 264 aa  352  5e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2589  thymidylate synthase  61.99 
 
 		 264 aa  351  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1471  thymidylate synthase  61.89 
 
 		 283 aa  351  8.999999999999999e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1410  hypothetical protein  61.25 
 
 		 264 aa  350  1e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.290298 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2782  Thymidylate synthase  62.73 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0986115  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2660  thymidylate synthase  63.1 
 
 		 264 aa  348  4e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.742104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1581  thymidylate synthase  60.52 
 
 		 264 aa  348  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000941291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04649  thymidylate synthase  63.47 
 
 		 264 aa  348  8e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0874843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0901  thymidylate synthase  61.62 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2887  Thymidylate synthase  62.73 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.189852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0662  thymidylate synthase  63.84 
 
 		 264 aa  347  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2832  thymidylate synthase  63.1 
 
 		 264 aa  346  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2747  Thymidylate synthase  60.56 
 
 		 277 aa  346  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1854  thymidylate synthase  61.62 
 
 		 264 aa  344  8.999999999999999e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.247947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1242  thymidylate synthase  60.21 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0595722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13308  thymidylate synthase  58.8 
 
 		 274 aa  340  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.372372  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2861  thymidylate synthase  60.15 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.390329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2943  thymidylate synthase  60.15 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0433853  normal  0.782101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0867  thymidylate synthase  60.15 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.126958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5002  thymidylate synthase  61.17 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000135835  normal  0.749841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0371  thymidylate synthase  61.25 
 
 		 264 aa  338  8e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.634386  normal  0.315482 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2781  thymidylate synthase  60.52 
 
 		 264 aa  335  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3147  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  334  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0864  Thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  334  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2974  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  334  9e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0248193  normal  0.0110834 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4093  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  334  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00531915  normal  0.186397 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02675  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0328967  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2730  thymidylate synthase  60.45 
 
 		 267 aa  333  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0137265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1335  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0097  thymidylate synthase  59.41 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1449  thymidylate synthase  61.99 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2973  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.942182  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0888  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3039  thymidylate synthase  59.41 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.448535 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02636  hypothetical protein  59.04 
 
 		 264 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0282174  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1146  thymidylate synthase  58.67 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.153676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2927  thymidylate synthase  60.15 
 
 		 264 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03706  thymidylate synthase  57.39 
 
 		 277 aa  333  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1504  thymidylate synthase  61.62 
 
 		 264 aa  332  4e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0699  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  332  4e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3035  thymidylate synthase  58.67 
 
 		 264 aa  331  8e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.14983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0600  Thymidylate synthase  58.3 
 
 		 269 aa  331  9e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2779  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.629836  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1188  thymidylate synthase  58.3 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122155  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4525  thymidylate synthase  60.15 
 
 		 264 aa  329  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.659361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3125  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 264 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  0.408001 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1729  thymidylate synthase  58.45 
 
 		 277 aa  329  2e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3238  thymidylate synthase  58.3 
 
 		 264 aa  329  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.488211  normal  0.397559 
 
 
-
 
NC_002950  PG2060  thymidylate synthase  59.78 
 
 		 267 aa  329  3e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1265  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.678251  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1232  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 264 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.902192  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0984  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 264 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00298799  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1036  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 264 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4491  thymidylate synthase  60.74 
 
 		 276 aa  328  8e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0915  thymidylate synthase  59.04 
 
 		 264 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3195  thymidylate synthase  57.93 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1091  thymidylate synthase  58.67 
 
 		 264 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3269  thymidylate synthase  57.2 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0325419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17460  thymidylate synthase  58.96 
 
 		 276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.171384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2568  thymidylate synthase  58.3 
 
 		 264 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.239334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0889  thymidylate synthase  57.56 
 
 		 280 aa  325  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.699626 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>