More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4918 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4918  D-alanine--D-alanine ligase  100 
 
 
439 aa  852    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.592634  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0998  D-alanine/D-alanine ligase  36.57 
 
 
414 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0486  D-alanine--D-alanine ligase  27.27 
 
 
361 aa  190  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  31.52 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  29.43 
 
 
362 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  29.86 
 
 
361 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  29.62 
 
 
361 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  28.47 
 
 
362 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  29.58 
 
 
361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  29.62 
 
 
361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1246  D-alanine--D-alanine ligase  34.7 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000908646 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  29.34 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  29.34 
 
 
361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  29.38 
 
 
361 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  30.88 
 
 
363 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  30.9 
 
 
362 aa  160  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  32.48 
 
 
360 aa  159  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  34.21 
 
 
376 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  32.09 
 
 
363 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0599  D-alanine--D-alanine ligase  33.02 
 
 
369 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  32.01 
 
 
363 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  31.76 
 
 
358 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  30.82 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0634  D-alanyl-alanine synthetase A  26.49 
 
 
346 aa  144  4e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.233428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1090  D-alanine--D-alanine ligase  32.46 
 
 
371 aa  142  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  27.71 
 
 
380 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  29.45 
 
 
366 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  32.86 
 
 
382 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  35.47 
 
 
360 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  32.8 
 
 
377 aa  139  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  34.31 
 
 
356 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  34.31 
 
 
356 aa  138  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  33.47 
 
 
357 aa  138  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  28.67 
 
 
351 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  36.16 
 
 
370 aa  136  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  38.84 
 
 
350 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  35.69 
 
 
360 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  33.75 
 
 
365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  28.87 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  28.87 
 
 
364 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  28.44 
 
 
351 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  32.14 
 
 
355 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  32.25 
 
 
364 aa  133  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  32.92 
 
 
364 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  33.08 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 
373 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  28.54 
 
 
360 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  30.62 
 
 
362 aa  131  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1152  D-alanyl-alanine synthetase A  27.74 
 
 
347 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00719746  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  29.7 
 
 
353 aa  130  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  32.24 
 
 
367 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  30.02 
 
 
367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  33.06 
 
 
361 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  32.81 
 
 
376 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  27.54 
 
 
366 aa  126  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0808  D-alanyl-alanine synthetase A  26.65 
 
 
345 aa  126  9e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.441448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  35.61 
 
 
363 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  32.84 
 
 
364 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  32.84 
 
 
364 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  32.84 
 
 
364 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  33.21 
 
 
367 aa  124  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  36.58 
 
 
350 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1208  D-alanyl-alanine synthetase A  27.92 
 
 
345 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  32.84 
 
 
364 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  32.84 
 
 
364 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  28.71 
 
 
358 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1050  D-alanine/D-alanine ligase  28.36 
 
 
344 aa  124  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2251  D-alanyl-alanine synthetase A  30.33 
 
 
382 aa  124  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000796375 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  27.05 
 
 
353 aa  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  35.08 
 
 
352 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1308  D-alanyl-alanine synthetase A  36.52 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375804  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  35.34 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  31.97 
 
 
361 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  39.42 
 
 
400 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  25.35 
 
 
355 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  33.2 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0388  D-ala D-ala ligase  30.82 
 
 
375 aa  120  4.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.822373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  29.41 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0572  D-alanyl-alanine synthetase A  30.42 
 
 
342 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.140397  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  28.2 
 
 
357 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  37.99 
 
 
350 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  38.82 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 
366 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  33.07 
 
 
366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2310  D-alanine/D-alanine ligase  33.25 
 
 
389 aa  117  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0189199  hitchhiker  0.00305681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  36.17 
 
 
377 aa  117  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  35.31 
 
 
394 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  31.87 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  31.87 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0143  bifunctional D-alanyl-alanine synthetase A/UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  26.8 
 
 
833 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.714064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  31.87 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  31.87 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  31.87 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  31.87 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  31.87 
 
 
364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2952  D-alanine--D-alanine ligase  39.75 
 
 
351 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0672  D-alanyl-alanine synthetase A  26.34 
 
 
377 aa  116  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00380934  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  25.59 
 
 
353 aa  116  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1595  D-alanyl-alanine synthetase A  36.3 
 
 
372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0878073  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  33.33 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>