More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0808 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0808  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 345 aa  690    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.441448  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1152  D-alanyl-alanine synthetase A  64.53 
 
 		 347 aa  428  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00719746  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0889  D-alanyl-alanine synthetase A  57.93 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0819  D-alanyl-alanine synthetase A  57.93 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.966668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1212  D-alanyl-alanine synthetase A  57.93 
 
 		 346 aa  389  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0634  D-alanyl-alanine synthetase A  55.62 
 
 		 346 aa  374  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.233428  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0572  D-alanyl-alanine synthetase A  51.46 
 
 		 342 aa  368  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.140397  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1050  D-alanine/D-alanine ligase  50.29 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1208  D-alanyl-alanine synthetase A  52.45 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  29.73 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1246  D-alanine--D-alanine ligase  29.62 
 
 		 408 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000908646 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  29.12 
 
 		 368 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0998  D-alanine/D-alanine ligase  26.69 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4918  D-alanine--D-alanine ligase  30.22 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.592634  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  29.41 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  29.55 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  28.53 
 
 		 366 aa  123  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  29.14 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  28.57 
 
 		 366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  29.47 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  29.47 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  27.6 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  30.51 
 
 		 380 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0486  D-alanine--D-alanine ligase  32.42 
 
 		 361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  27.89 
 
 		 351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  29.39 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  29.39 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  29.09 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0599  D-alanine--D-alanine ligase  26.69 
 
 		 369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  29.39 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  29.39 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  29.39 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  29.39 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  29.39 
 
 		 364 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  30.46 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  27.03 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  28.49 
 
 		 353 aa  116  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15051  D-alanyl-alanine synthetase A  31.33 
 
 		 355 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.442673  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  31.46 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  32.64 
 
 		 305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  27.76 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  27.81 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  28.01 
 
 		 366 aa  114  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  28.53 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  29.17 
 
 		 361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  28.44 
 
 		 367 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  30.21 
 
 		 360 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  27.46 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  27.54 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  29.3 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  31.79 
 
 		 363 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  27.84 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  28.44 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  29.32 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  28.53 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  27.03 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1402  D-alanyl-alanine synthetase A  30.95 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  27.43 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  26.56 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  28.05 
 
 		 367 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  29.6 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14921  D-alanyl-alanine synthetase A  29.7 
 
 		 355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  30.21 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  27.91 
 
 		 364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  28.66 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  27.07 
 
 		 351 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  28.53 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  28.53 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  28.53 
 
 		 364 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  28.53 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  29.22 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  28.22 
 
 		 364 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  27.59 
 
 		 355 aa  109  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  28.22 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  29.34 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  29.34 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  29.64 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  28.03 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  29.64 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  29.27 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  27.75 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  26.32 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  26.86 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  29.34 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  26.96 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  30.99 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  28.57 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  25.39 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  27.22 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  26.93 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  31.17 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  26.28 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1680  D-alanine/D-alanine ligase  26.87 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344983  hitchhiker  0.00583012 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  28.74 
 
 		 362 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  29.78 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  30.06 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  26.91 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  29.04 
 
 		 361 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  28.61 
 
 		 357 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13541  D-alanine--D-alanine ligase  27.54 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.337392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>