More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0572 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0572  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 342 aa  691    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.140397  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1152  D-alanyl-alanine synthetase A  58.02 
 
 		 347 aa  423  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00719746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0634  D-alanyl-alanine synthetase A  51.76 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.233428  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1050  D-alanine/D-alanine ligase  53.78 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0808  D-alanyl-alanine synthetase A  51.46 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.441448  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1212  D-alanyl-alanine synthetase A  52.06 
 
 		 346 aa  366  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0889  D-alanyl-alanine synthetase A  51.76 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0819  D-alanyl-alanine synthetase A  51.76 
 
 		 346 aa  364  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.966668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1208  D-alanyl-alanine synthetase A  53.04 
 
 		 345 aa  357  9.999999999999999e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1246  D-alanine--D-alanine ligase  28.61 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000908646 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  28.31 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  31.27 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0599  D-alanine--D-alanine ligase  27.69 
 
 		 369 aa  123  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0998  D-alanine/D-alanine ligase  26.23 
 
 		 414 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  28.84 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  28.84 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  29.85 
 
 		 368 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  29.17 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4918  D-alanine--D-alanine ligase  30.77 
 
 		 439 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.592634  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  29.17 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  29.46 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  29.46 
 
 		 361 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  29.17 
 
 		 361 aa  119  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  28.53 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  30.65 
 
 		 367 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  29.46 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  29.46 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  28.96 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  29.03 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  28.49 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  28.36 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  29.75 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  25.67 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  26.27 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08980  D-alanine--D-alanine ligase  30.43 
 
 		 343 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3506  D-alanine--D-alanine ligase  29.46 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.109153  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  27.98 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  30.3 
 
 		 359 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  27.61 
 
 		 366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  27.73 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  27.44 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  28.36 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  26.7 
 
 		 370 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  30.03 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  31.25 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12996  D-alanyl-alanine synthetase A  28.7 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00428062  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  27.44 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  27.44 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  27.44 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  27.44 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  28.79 
 
 		 346 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  27.44 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  27.44 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  27.44 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  28.99 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  27.81 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  28.96 
 
 		 355 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2101  D-alanyl-alanine synthetase A  27.03 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0423676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  25 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  28.57 
 
 		 346 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  30.96 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  28.07 
 
 		 351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  27.22 
 
 		 351 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  30.24 
 
 		 360 aa  109  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  26.65 
 
 		 366 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4592  D-alanine--D-alanine ligase  26.12 
 
 		 393 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79248  normal  0.646635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  29.02 
 
 		 348 aa  110  5e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  27.84 
 
 		 350 aa  109  6e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  27.55 
 
 		 339 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  29.16 
 
 		 363 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  28.03 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  27.7 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  31.72 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  27.7 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  27.81 
 
 		 344 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  25.8 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  27.76 
 
 		 371 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  26.56 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  25.83 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  26.56 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  29.14 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  28.75 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  27.13 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  26.25 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  26.25 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  26.25 
 
 		 364 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4044  D-alanine/D-alanine ligase  26.7 
 
 		 384 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  27.46 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  30.09 
 
 		 373 aa  106  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  25.68 
 
 		 366 aa  106  7e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  28.65 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  28.65 
 
 		 356 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14671  D-alanyl-alanine synthetase A  30.36 
 
 		 355 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0791512  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  26.95 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0107  D-alanyl-alanine synthetase A  29.91 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0129798  hitchhiker  0.000000000349499 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  28.48 
 
 		 364 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  30.77 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  29.31 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  27.78 
 
 		 367 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  28.78 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>