More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1208 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1208  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 345 aa  700    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1050  D-alanine/D-alanine ligase  56.94 
 
 		 344 aa  384  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1152  D-alanyl-alanine synthetase A  56.07 
 
 		 347 aa  370  1e-101  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00719746  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1212  D-alanyl-alanine synthetase A  53.76 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0634  D-alanyl-alanine synthetase A  53.47 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.233428  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0889  D-alanyl-alanine synthetase A  52.31 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0819  D-alanyl-alanine synthetase A  52.31 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.966668  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0572  D-alanyl-alanine synthetase A  53.04 
 
 		 342 aa  357  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.140397  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0808  D-alanyl-alanine synthetase A  52.45 
 
 		 345 aa  344  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.441448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0998  D-alanine/D-alanine ligase  26.68 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  29.25 
 
 		 368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  29.68 
 
 		 367 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  27.27 
 
 		 355 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  29.36 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  29.36 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  29.75 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  29.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  29.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  29.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  29.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  29.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  29.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  29.75 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1246  D-alanine--D-alanine ligase  27.82 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000908646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  30.03 
 
 		 360 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  28.33 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  30.61 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  28.99 
 
 		 348 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  30.9 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  29.52 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  29.53 
 
 		 394 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0599  D-alanine--D-alanine ligase  27.44 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  29.17 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0486  D-alanine--D-alanine ligase  27.86 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  28.96 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  26.94 
 
 		 362 aa  119  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  34.08 
 
 		 305 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  27.05 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  27.05 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  27.05 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  27.05 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  31.14 
 
 		 371 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  27.05 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  28.91 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  28.12 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  30.38 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  26.68 
 
 		 370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  27.59 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  29.85 
 
 		 360 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  28.9 
 
 		 360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  28.24 
 
 		 383 aa  116  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  33.63 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  28.1 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  28.31 
 
 		 361 aa  116  6e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  28.1 
 
 		 371 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1631  D-alanyl-alanine synthetase A  31.43 
 
 		 360 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  28.1 
 
 		 371 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  27.32 
 
 		 361 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  27.41 
 
 		 364 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  30.07 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  30.82 
 
 		 363 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  30.28 
 
 		 363 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  28.09 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  28.94 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  28.09 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  28.09 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  27.14 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5376  D-alanine/D-alanine ligase  28.06 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1244  D-alanine/D-alanine ligase  32.13 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00234913  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  29.94 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  27.08 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  28.12 
 
 		 344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  27.88 
 
 		 367 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  27.58 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  28.31 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  30.63 
 
 		 364 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  26.23 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  28.61 
 
 		 367 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  25.14 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  29 
 
 		 376 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  27.47 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  29.33 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  29.88 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  27.47 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2342  D-alanyl-alanine synthetase A  26.88 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.958781 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  27.64 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0667  D-alanine/D-alanine ligase  33.18 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.621467  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2514  D-alanyl-alanine synthetase A  27.93 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.94876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  24.14 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  27.13 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  29.31 
 
 		 346 aa  109  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0922  D-alanyl-alanine synthetase A  26.15 
 
 		 382 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  26.93 
 
 		 367 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  28.05 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11160  D-alanine--D-alanine ligase  28 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0940695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8008  D-alanine--D-alanine ligase  29.18 
 
 		 369 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  26.8 
 
 		 377 aa  108  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  28.53 
 
 		 353 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  33.18 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  24.76 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>