More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1212 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0889  D-alanyl-alanine synthetase A  96.82 
 
 		 346 aa  669    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1212  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 346 aa  689    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0819  D-alanyl-alanine synthetase A  96.82 
 
 		 346 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.966668  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0634  D-alanyl-alanine synthetase A  68.5 
 
 		 346 aa  487  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.233428  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1152  D-alanyl-alanine synthetase A  58.26 
 
 		 347 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00719746  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1050  D-alanine/D-alanine ligase  54.49 
 
 		 344 aa  392  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0808  D-alanyl-alanine synthetase A  57.93 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.441448  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1208  D-alanyl-alanine synthetase A  53.76 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0572  D-alanyl-alanine synthetase A  52.06 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.140397  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  30.81 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  30.75 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  30.53 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  31.52 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  30.53 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  30.53 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  29.76 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  29.72 
 
 		 364 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  29.91 
 
 		 361 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  29.91 
 
 		 361 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  29.81 
 
 		 362 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  30.97 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1246  D-alanine--D-alanine ligase  27.82 
 
 		 408 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000908646 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  29.28 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  29.6 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0486  D-alanine--D-alanine ligase  30.2 
 
 		 361 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0387  D-alanyl-alanine synthetase A  30.52 
 
 		 367 aa  123  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0998  D-alanine/D-alanine ligase  23.58 
 
 		 414 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  29.81 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  26.27 
 
 		 368 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  29.67 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1162  D-alanine--D-alanine ligase  26.49 
 
 		 360 aa  119  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000524603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3609  D-alanyl-alanine synthetase A  26.15 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2618  D-alanyl-alanine synthetase A  32.15 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0599  D-alanine--D-alanine ligase  27.36 
 
 		 369 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  27.79 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  25.29 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  27.94 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2721  D-alanyl-alanine synthetase A  30.34 
 
 		 361 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0289964  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  27.05 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  26.2 
 
 		 364 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  27.9 
 
 		 365 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  29.11 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  29.47 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  25.14 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2121  D-alanyl-alanine synthetase A  27.13 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  30.51 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  26.99 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19931  D-alanyl-alanine synthetase A  27.95 
 
 		 353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.115642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  25.88 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0610  D-alanyl-alanine synthetase A  28.13 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  29.27 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  25 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  28.88 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  24.27 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0767  D-alanyl-alanine synthetase A  26.87 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2856  D-alanine/D-alanine ligase  26.4 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  27.73 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  25.45 
 
 		 364 aa  113  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  25.45 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  25.45 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  25.45 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  25.45 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  25.45 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  25.45 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  25.45 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  25.14 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  25.14 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  25.14 
 
 		 371 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  26.94 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2158  D-alanyl-alanine synthetase A  29.6 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1603  D-alanine/D-alanine ligase  27.3 
 
 		 362 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2120  D-alanyl-alanine synthetase A  29.6 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.183623  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1690  D-alanyl-alanine synthetase A  29.82 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.820491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  28.05 
 
 		 305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  27.3 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3354  D-alanyl-alanine synthetase A  24.66 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  29.17 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0407  D-alanine/D-alanine ligase  25.29 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  29.52 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1636  D-alanine/D-alanine ligase  28.19 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  28.05 
 
 		 305 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1541  D-alanyl-alanine synthetase A  26 
 
 		 350 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2792  D-alanine/D-alanine ligase  26.1 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.349975  normal  0.237488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2285  D-alanine/D-alanine ligase  25.56 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.249142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  29.18 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2763  D-alanyl-alanine synthetase A  24.46 
 
 		 351 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.118485  hitchhiker  0.00665374 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2199  D-alanine--D-alanine ligase  27.08 
 
 		 305 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.171774  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3455  D-alanine/D-alanine ligase  26.09 
 
 		 336 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0409597  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  25.76 
 
 		 351 aa  109  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0143  bifunctional D-alanyl-alanine synthetase A/UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  29.41 
 
 		 833 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.714064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4918  D-alanine--D-alanine ligase  27.92 
 
 		 439 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.592634  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1544  D-alanyl-alanine synthetase A  27.16 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  25.71 
 
 		 367 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  24.86 
 
 		 367 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  25.55 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  23.8 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1108  D-alanine--D-alanine ligase  27.86 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  25.55 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  27.64 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  25.55 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>