138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2782 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2782  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  100 
 
 
252 aa  525  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000207909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1062  negative regulator of beta-lactamase expression-like protein  32.89 
 
 
222 aa  119  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4820  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.33 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0627398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2966  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  33.67 
 
 
242 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000101487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  53.33 
 
 
1223 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  48.98 
 
 
660 aa  58.5  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  52.27 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  50.98 
 
 
767 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  48 
 
 
624 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  59.09 
 
 
920 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  45.1 
 
 
629 aa  55.5  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3587  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  26.29 
 
 
467 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115346  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  44.9 
 
 
631 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  56.82 
 
 
447 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  52.27 
 
 
1226 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.73 
 
 
1234 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2738  S-layer domain-containing protein  42.59 
 
 
466 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.175202  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  50 
 
 
531 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03370  S-layer domain protein  46.94 
 
 
396 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  51.06 
 
 
1321 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  54.76 
 
 
1081 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  47.73 
 
 
685 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.27 
 
 
419 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  46 
 
 
669 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  40 
 
 
693 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  44.23 
 
 
932 aa  52  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  55.56 
 
 
506 aa  52  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3267  S-layer domain protein  40.38 
 
 
211 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.698086  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  45.28 
 
 
1009 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.81 
 
 
242 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  46.94 
 
 
548 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6415  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.59 
 
 
551 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  41.3 
 
 
4630 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  45.83 
 
 
3027 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  48.94 
 
 
935 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  41.51 
 
 
807 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  29.61 
 
 
573 aa  51.2  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3112  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.14 
 
 
496 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  47.73 
 
 
921 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  40.43 
 
 
710 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  50 
 
 
688 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  47.92 
 
 
926 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  40.38 
 
 
542 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  44.68 
 
 
1756 aa  50.1  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.9 
 
 
1029 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0423  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  34.58 
 
 
181 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000285307  normal  0.0465773 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.3 
 
 
1328 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3859  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.88 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000140169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  45.1 
 
 
526 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  45.1 
 
 
575 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2183  hypothetical protein  39.22 
 
 
570 aa  49.7  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  39.62 
 
 
822 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  35.85 
 
 
431 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2196  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  30.86 
 
 
490 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.800961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  45.65 
 
 
457 aa  49.3  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0212  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  39.68 
 
 
418 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.521983 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  42.59 
 
 
758 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1184  hypothetical protein  40.38 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0635608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  44.68 
 
 
218 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  25.43 
 
 
625 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4827  S-layer domain-containing protein  42.86 
 
 
521 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3916  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.15 
 
 
187 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154169  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  52.5 
 
 
1421 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  40.38 
 
 
1208 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0421  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  34.58 
 
 
181 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  48.89 
 
 
1821 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  41.51 
 
 
1168 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  43.64 
 
 
2313 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2478  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 
387 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0177612  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3420  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  28.15 
 
 
180 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.313101  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4057  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  30.88 
 
 
187 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00018717  normal  0.269643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1933  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  24.71 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1955  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.9 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1260  hypothetical protein  48.94 
 
 
1184 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  42.31 
 
 
1174 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  40.82 
 
 
657 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  45.45 
 
 
857 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  43.4 
 
 
693 aa  46.6  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0278  S-layer domain protein  41.18 
 
 
282 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000762211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3389  Negative regulator of beta-lactamase expression- like protein  25.41 
 
 
480 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.89 
 
 
640 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  42.86 
 
 
1194 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  42.59 
 
 
1013 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  29.63 
 
 
404 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.15 
 
 
995 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2282  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25.14 
 
 
641 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.169822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.66 
 
 
471 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  40.82 
 
 
748 aa  45.8  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  36.54 
 
 
414 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  40 
 
 
413 aa  45.4  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  42.86 
 
 
585 aa  45.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3937  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 
187 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5785  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.17 
 
 
477 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204427  normal  0.0325548 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1458  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.04 
 
 
275 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  39.22 
 
 
692 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  37.25 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  38.46 
 
 
558 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  37.25 
 
 
383 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0425  N-acetyl-anhydromuranmyl-L-alanine amidase  33.64 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.81 
 
 
1231 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>