220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2367 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2367  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
365 aa  766    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128404  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3253  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 
369 aa  205  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0227534  normal  0.148006 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0450  putative polysaccharide biosynthesis protein  34.13 
 
 
365 aa  67  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
395 aa  62.8  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  31.4 
 
 
360 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  32.34 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3745  group 1 glycosyl transferase  31.18 
 
 
385 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  24.08 
 
 
368 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0090  glycosyl transferase, group 1  31.76 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.22562 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1410  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.6 
 
 
379 aa  57  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  24.53 
 
 
350 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
350 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  24.53 
 
 
350 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  24.53 
 
 
350 aa  53.9  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0399  glycosyl transferase, group 1  31.67 
 
 
377 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 
389 aa  53.5  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  24.22 
 
 
350 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  24.16 
 
 
436 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 
344 aa  53.1  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  24.53 
 
 
400 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0304  putative glycosyl transferase  21.51 
 
 
426 aa  52.4  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
447 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4590  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 
375 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.947068  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4950  glycosyl transferase  24.69 
 
 
360 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00550219  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0051  SqdX  36.08 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.83 
 
 
376 aa  51.6  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  22.08 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00501  SqdX  37.3 
 
 
381 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  28.76 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
356 aa  51.2  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  23.08 
 
 
376 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  48.89 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  48.89 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17931  SqdX  37.9 
 
 
382 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.335649  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.12 
 
 
360 aa  50.4  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
372 aa  50.4  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3612  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0364  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
391 aa  50.4  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.244589  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2502  glycosyl transferase group 1  36.52 
 
 
377 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.861736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0116  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 
341 aa  50.4  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000347461 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  48 
 
 
371 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0341  glycosyl transferase, group 1  32.61 
 
 
344 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  30.54 
 
 
377 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5113  glycosyl transferase, group 1  34.78 
 
 
382 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00756342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
409 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
396 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4643  glycosyl transferase group 1  39.13 
 
 
376 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000017343  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
403 aa  49.7  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1661  glycosyl transferase, group 1  24.55 
 
 
366 aa  49.7  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000116715  hitchhiker  0.00132012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 
385 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  25.33 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  21.32 
 
 
422 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0048  SqdX  38.79 
 
 
382 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 
371 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4043  glycosyl transferase, group 1  23.21 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121484  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  27.53 
 
 
342 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  52.38 
 
 
345 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  32 
 
 
373 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  31.13 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1254  glycosyl transferase, group 1  33.88 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.163689  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  36.52 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4916  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
377 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559859 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31.72 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5562  glycosyl transferase, group 1 family protein  30 
 
 
356 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 
367 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  32.03 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  36.52 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  22.09 
 
 
395 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3179  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
403 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  31.45 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
378 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  23.45 
 
 
356 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
739 aa  47.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 
394 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1758  SqdX  36.52 
 
 
377 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1267  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
411 aa  47.4  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0583334  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  40.3 
 
 
1302 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  47.27 
 
 
390 aa  47.4  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18561  SqdX  36.52 
 
 
373 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.213199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0082  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
403 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0079  glycosyltransferase, putative  30 
 
 
403 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.471525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2253  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
433 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  54.76 
 
 
395 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2400  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
452 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1388  glycosyl transferase group 1  27.74 
 
 
354 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18751  SqdX  36.52 
 
 
377 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4401  glycosyl transferase group 1  23.77 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4615  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.352309  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18561  SqdX  36.52 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  32.67 
 
 
362 aa  46.6  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
750 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
406 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  22.43 
 
 
404 aa  46.2  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6193  glycosyl transferase, group 1  23.46 
 
 
354 aa  46.2  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>