68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0700 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  6.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  51.8 
 
 
140 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  32.85 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  32.85 
 
 
140 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  33.09 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  32.37 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  33.09 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  31.75 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  33.81 
 
 
135 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  32.54 
 
 
142 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  28.06 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  33.33 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  29.01 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  31.54 
 
 
154 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  31.15 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  30.66 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  30.43 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  67  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  34.04 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  30 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  31.4 
 
 
177 aa  62  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  30.61 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  28.79 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  29.47 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  27.94 
 
 
173 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  29.13 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  34.01 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  31.75 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  29.5 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  29.5 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.86 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  34.78 
 
 
200 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  32.41 
 
 
203 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  36.46 
 
 
169 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  34.51 
 
 
202 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  29.03 
 
 
135 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  27.61 
 
 
143 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  29.1 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  24.53 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  32.41 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  30 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  31.62 
 
 
200 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  32.41 
 
 
203 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  29.1 
 
 
143 aa  48.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  31.62 
 
 
200 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  33.33 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  28.36 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  28.7 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  26.89 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  32.73 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  32.73 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  36.71 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  32.73 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  32.73 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  29.77 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  26.56 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  29.46 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  33.33 
 
 
203 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  32 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  30.97 
 
 
202 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  32 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  32 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3585  hypothetical protein  30.83 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00067861 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  34.78 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  25.89 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  28.35 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  27.14 
 
 
223 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  30.43 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>