More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0588 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  99 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  57.95 
 
 		 201 aa  241  6e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  50.25 
 
 		 200 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  49.25 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  45.27 
 
 		 202 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  44.5 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  44.5 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  44 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  45 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  30.95 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  27.91 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  30.16 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  30.89 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  29.27 
 
 		 135 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  30.89 
 
 		 137 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  39 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  30.23 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  32.8 
 
 		 134 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  32.35 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  33.02 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  32.05 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  32.05 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  38.96 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  26.98 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  37.84 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  33.78 
 
 		 103 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 103 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  32.43 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0491  glutaredoxin-related protein  38.89 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  37.62 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  42.11 
 
 		 85 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  30.49 
 
 		 442 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  32.5 
 
 		 112 aa  53.1  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0302  glutaredoxin  40.32 
 
 		 278 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0247892  normal  0.580152 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 107 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  33.8 
 
 		 114 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  30.49 
 
 		 459 aa  52  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 107 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 		 107 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  25.4 
 
 		 143 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 103 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 128 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 103 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 103 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 103 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0146  glutaredoxin-like protein  30.93 
 
 		 102 aa  51.6  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0057357  normal  0.16903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 103 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 103 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  30.77 
 
 		 110 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  25.6 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3117  glutaredoxin-like protein  33.33 
 
 		 113 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.736059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 112 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 103 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  25.6 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  30.99 
 
 		 109 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  29.73 
 
 		 103 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 115 aa  51.2  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 107 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  30.99 
 
 		 103 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  28.38 
 
 		 117 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  29.49 
 
 		 84 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1186  glutaredoxin-like protein  31.94 
 
 		 112 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  29.58 
 
 		 109 aa  50.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  29.58 
 
 		 110 aa  49.3  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  30.63 
 
 		 142 aa  49.7  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2460  glutaredoxin-like protein  38.57 
 
 		 109 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  29.79 
 
 		 111 aa  49.7  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  32.05 
 
 		 84 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_27972  predicted protein  28.57 
 
 		 338 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0259  glutaredoxin-related protein  32.88 
 
 		 110 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  36.76 
 
 		 80 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  30.14 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  30.14 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  30.14 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2174  glutaredoxin family protein  33.33 
 
 		 90 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.629195  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  30.14 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  30.14 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  30.14 
 
 		 102 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  32.05 
 
 		 84 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  25.68 
 
 		 103 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 		 110 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  31.08 
 
 		 108 aa  48.9  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  30.14 
 
 		 102 aa  48.9  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  31.65 
 
 		 86 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0677  glutaredoxin-like protein  30 
 
 		 111 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.835173  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4207  glutaredoxin 3  36.71 
 
 		 86 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.720183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  34.21 
 
 		 82 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  30.09 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  34.67 
 
 		 87 aa  48.9  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0963  glutaredoxin-like protein  31.51 
 
 		 111 aa  48.5  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000957456 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  32.88 
 
 		 108 aa  48.5  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  31.17 
 
 		 89 aa  48.5  0.00007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4407  glutaredoxin  35 
 
 		 261 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>