51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05593 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  91.79 
 
 
134 aa  252  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  60.47 
 
 
130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  43.61 
 
 
169 aa  114  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  37.59 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  36.84 
 
 
143 aa  96.3  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  35.34 
 
 
143 aa  94  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  35.48 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  36.8 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  36.8 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  36.8 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  36.8 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  36.8 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  36.29 
 
 
137 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  34.71 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  34.38 
 
 
133 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  34.38 
 
 
133 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  37.14 
 
 
223 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  33.59 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  36 
 
 
130 aa  83.6  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  33.85 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  33.6 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  33.6 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  31.45 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  32.26 
 
 
135 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  32.38 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  39 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  33.06 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  39 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  32.35 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  31.43 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  31.37 
 
 
201 aa  63.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  28.24 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  34.86 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  30.65 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  34.13 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  30.47 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  30 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  27.93 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  26.83 
 
 
144 aa  47.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  27.93 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  27.16 
 
 
203 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  28.46 
 
 
135 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  27.85 
 
 
203 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  25.93 
 
 
203 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  31.37 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  22.83 
 
 
150 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  25.93 
 
 
203 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>