51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0531 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  265  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  60.47 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  59.69 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  45.16 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  39.84 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  39.02 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  40.8 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  39.84 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  39.84 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  37.4 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  95.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  95.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  36.59 
 
 		 147 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  38.4 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  38.4 
 
 		 143 aa  87  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  37.78 
 
 		 223 aa  85.9  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  36.8 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  37.6 
 
 		 143 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  35.77 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  37.01 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  45.24 
 
 		 84 aa  67  0.00000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  31.01 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  30.23 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  32.71 
 
 		 128 aa  60.1  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  32.26 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  27.12 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  27.52 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  29.41 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  31.75 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  31.31 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  31.45 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  28.3 
 
 		 203 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  27.34 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.37 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  27.36 
 
 		 203 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  27.48 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  27.36 
 
 		 203 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  30.08 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  25.2 
 
 		 150 aa  43.5  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  26.02 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  29.03 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  27.56 
 
 		 149 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  30.26 
 
 		 203 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  23.2 
 
 		 140 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  22.22 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>