61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0710 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  100 
 
 		 169 aa  350  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  50.37 
 
 		 141 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  50.37 
 
 		 141 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  50.37 
 
 		 141 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  50.37 
 
 		 141 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  49.63 
 
 		 141 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  47.41 
 
 		 143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  47.41 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  48.15 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  48.15 
 
 		 143 aa  129  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  43.85 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  43.38 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  42.31 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  40.77 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  40.77 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  45.16 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  43.61 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  42.64 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  42.64 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  42.75 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  41.35 
 
 		 134 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  41.73 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  40.71 
 
 		 223 aa  99.4  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  39.37 
 
 		 144 aa  91.7  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  36.67 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  35.25 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  36.11 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  35.85 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  69.3  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  32.35 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  32.35 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  30.56 
 
 		 203 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  32.38 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  29.63 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  29.63 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  33.07 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  27.27 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  36.46 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  29.06 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  26.15 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2596  protein of unknown function DUF296  27.05 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  33.9 
 
 		 154 aa  49.3  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  26.61 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  24.59 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  28 
 
 		 135 aa  47.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0204  protein of unknown function DUF296  26.56 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.021893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.63 
 
 		 135 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  25 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  27.54 
 
 		 161 aa  44.3  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  29.52 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  28.71 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  28.71 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  26.95 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  23.02 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  26.92 
 
 		 139 aa  41.2  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.78 
 
 		 141 aa  40.8  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  29.84 
 
 		 146 aa  40.8  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>