More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1894 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  407  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  80.2 
 
 
200 aa  331  5e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  62.44 
 
 
201 aa  274  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  49.25 
 
 
200 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  49.25 
 
 
200 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  48.76 
 
 
202 aa  209  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  42.36 
 
 
203 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  42.36 
 
 
203 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  40.39 
 
 
203 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  43.07 
 
 
203 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  44.44 
 
 
137 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  46.3 
 
 
134 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  40.74 
 
 
147 aa  90.1  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  89.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  35.29 
 
 
135 aa  88.2  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  41.67 
 
 
133 aa  85.1  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  41.67 
 
 
135 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  36.67 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  38.68 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  40.38 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  35.43 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  35.43 
 
 
143 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  34.65 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  34.65 
 
 
143 aa  72  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  36.89 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  36.89 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  36.89 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  32.09 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  36.89 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  48.15 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32.38 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  35.92 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2437  thioredoxin reductase  39.24 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.24 
 
 
459 aa  66.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  40.74 
 
 
84 aa  64.3  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  46.91 
 
 
86 aa  64.7  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  44.3 
 
 
82 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  44.3 
 
 
82 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  44.3 
 
 
82 aa  63.2  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2348  glutaredoxin 3  38.75 
 
 
115 aa  62.8  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000217379  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  41.25 
 
 
88 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  33.77 
 
 
85 aa  60.5  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  35.8 
 
 
88 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  39.24 
 
 
84 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  39.74 
 
 
92 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  42.31 
 
 
83 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  42.31 
 
 
83 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  42.31 
 
 
83 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  42.31 
 
 
83 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  42.31 
 
 
83 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2801  glutaredoxin-like protein  38.16 
 
 
103 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.420164 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  37.5 
 
 
89 aa  58.5  0.00000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  39.47 
 
 
88 aa  58.2  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  39.47 
 
 
88 aa  58.2  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2076  glutaredoxin 3  32.95 
 
 
101 aa  58.2  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3150  glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 
103 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0389298  normal  0.0157235 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
83 aa  58.2  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  42.65 
 
 
84 aa  58.2  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  27.12 
 
 
130 aa  57.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  37.97 
 
 
85 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01971  glutaredoxin  35 
 
 
84 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.256062  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  35 
 
 
84 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  32.05 
 
 
81 aa  57.4  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  57.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
82 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  37.97 
 
 
85 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  36.71 
 
 
88 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2165  glutaredoxin  34.07 
 
 
101 aa  56.6  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3284  glutaredoxin  38.55 
 
 
88 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  37.8 
 
 
87 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01991  glutaredoxin  35 
 
 
84 aa  56.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  41.03 
 
 
82 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  35.53 
 
 
103 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  31.25 
 
 
86 aa  55.5  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0268  glutaredoxin 3  40.85 
 
 
82 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  37.36 
 
 
110 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  35.9 
 
 
88 aa  55.5  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  36.49 
 
 
243 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  40.85 
 
 
94 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  40.85 
 
 
94 aa  55.1  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  41.25 
 
 
85 aa  55.5  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  39.24 
 
 
90 aa  55.5  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  36.49 
 
 
243 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  41.18 
 
 
87 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  41.18 
 
 
87 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  38.89 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0120  glutaredoxin  40 
 
 
90 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  37.97 
 
 
84 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>