49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4088 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  263  7e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  97.74 
 
 		 133 aa  256  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  87.79 
 
 		 133 aa  224  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  87.02 
 
 		 133 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  87.02 
 
 		 133 aa  221  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  83.46 
 
 		 134 aa  220  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  84.96 
 
 		 137 aa  218  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  75.97 
 
 		 147 aa  193  7e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  69.7 
 
 		 135 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  71.32 
 
 		 135 aa  180  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  56 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  53.08 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  48.84 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  42.64 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  41.6 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  41.6 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  41.6 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  41.6 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  41.6 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  40.16 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  40.16 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  39.84 
 
 		 130 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  39.37 
 
 		 143 aa  95.1  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  38.58 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  40.18 
 
 		 200 aa  87  7e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 		 202 aa  86.3  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  40.74 
 
 		 202 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  37.82 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.6 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  37.06 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  32.8 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  29.37 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  29.37 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  34.26 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  33.96 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  33.02 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  34.91 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  38.1 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  27.05 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2596  protein of unknown function DUF296  34.21 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  33.67 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  26.56 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0204  protein of unknown function DUF296  29.01 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.021893  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  28.23 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  28.57 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  30.69 
 
 		 149 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  24.22 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  31.63 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>