49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4225 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  293  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  98.6 
 
 
143 aa  291  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  97.9 
 
 
143 aa  288  1e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  93.71 
 
 
143 aa  278  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  83.45 
 
 
141 aa  240  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  83.45 
 
 
141 aa  240  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  83.45 
 
 
141 aa  240  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  83.45 
 
 
141 aa  240  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  82.73 
 
 
141 aa  238  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  47.41 
 
 
169 aa  129  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  41.73 
 
 
135 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  42.06 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  40.16 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  40.16 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  40 
 
 
134 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  39.2 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  39.2 
 
 
133 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  39.2 
 
 
133 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.84 
 
 
134 aa  97.1  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  42.75 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  39.2 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  37.59 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  39.2 
 
 
135 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  37.6 
 
 
137 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  37.6 
 
 
130 aa  85.5  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  36.23 
 
 
223 aa  83.2  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  39.82 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  36.7 
 
 
201 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  35.43 
 
 
202 aa  74.3  0.0000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  37.61 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  23.97 
 
 
203 aa  64.3  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  26.17 
 
 
203 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  23.97 
 
 
203 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  28.85 
 
 
202 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  25.23 
 
 
203 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  37.8 
 
 
84 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  25.6 
 
 
200 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  25.6 
 
 
200 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  30.65 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  29.1 
 
 
140 aa  48.1  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  25.19 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  26.12 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  24.84 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.37 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  24.2 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  33.33 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  29.29 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  29.91 
 
 
140 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  32.14 
 
 
150 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>