48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4553 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  97.74 
 
 
133 aa  256  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  87.79 
 
 
133 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  87.02 
 
 
133 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  87.02 
 
 
133 aa  222  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  83.46 
 
 
134 aa  221  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  84.96 
 
 
137 aa  219  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  76.74 
 
 
147 aa  196  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  70.23 
 
 
135 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  71.32 
 
 
135 aa  180  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  56 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  53.08 
 
 
144 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  50.82 
 
 
128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  42.64 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  41.6 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  41.6 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  41.6 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  41.6 
 
 
141 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  41.6 
 
 
141 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  40.16 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  40.16 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  39.84 
 
 
130 aa  98.2  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  39.37 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  38.58 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  40.18 
 
 
200 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  41.67 
 
 
202 aa  85.1  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  40.74 
 
 
202 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.6 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  37.82 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  37.06 
 
 
223 aa  80.9  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  32.8 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  30.16 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  30.16 
 
 
200 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  34.26 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  34.26 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  34.26 
 
 
203 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  33.96 
 
 
203 aa  60.1  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  38.1 
 
 
84 aa  57.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  37.5 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  27.05 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  33.67 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0204  protein of unknown function DUF296  29.01 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.021893  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2596  protein of unknown function DUF296  34.21 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  28.57 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  24.22 
 
 
150 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  30.69 
 
 
149 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.03 
 
 
135 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>