29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0606 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  100 
 
 
150 aa  300  6.000000000000001e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  46 
 
 
144 aa  135  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0204  protein of unknown function DUF296  33.55 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.021893  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2596  protein of unknown function DUF296  28.7 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  25.95 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  25.95 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  28.12 
 
 
130 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  25 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  25.19 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  25.19 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  25.2 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  25 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  25.2 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  25.2 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  25.2 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  26.56 
 
 
134 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  25.78 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  24.41 
 
 
141 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  31.15 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  25.2 
 
 
130 aa  43.5  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  27.91 
 
 
144 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  22.83 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  24.22 
 
 
133 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  23.68 
 
 
134 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  24.35 
 
 
135 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  24.22 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  24 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>