21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0204 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0204  protein of unknown function DUF296  100 
 
 
146 aa  292  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.021893  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  33.55 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  30.77 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2596  protein of unknown function DUF296  30.77 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  28.1 
 
 
130 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  24.43 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  30.58 
 
 
134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  28.23 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  26.89 
 
 
137 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  27.13 
 
 
147 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  26.56 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  29.01 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  28.93 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  29.01 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  25.78 
 
 
193 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  30.91 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  28.93 
 
 
201 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  22.31 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  27.13 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  27.13 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  27.13 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>