48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3353 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  294  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  99.3 
 
 		 143 aa  291  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  97.9 
 
 		 143 aa  288  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  93.01 
 
 		 143 aa  273  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  83.45 
 
 		 141 aa  237  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  83.45 
 
 		 141 aa  237  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  83.45 
 
 		 141 aa  237  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  83.45 
 
 		 141 aa  237  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  82.73 
 
 		 141 aa  235  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  48.15 
 
 		 169 aa  128  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  42.06 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  39.2 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  39.2 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  40.94 
 
 		 135 aa  97.1  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  39.2 
 
 		 133 aa  97.1  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.84 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  42.75 
 
 		 144 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  39.37 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  39.37 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  39.2 
 
 		 134 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  37.59 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  37.6 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2660  hypothetical protein  38.4 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.643712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  38.46 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  38.4 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  34.78 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  38.05 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  35.78 
 
 		 201 aa  73.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  34.65 
 
 		 202 aa  72  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  36.7 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  23.97 
 
 		 203 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  26.17 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  23.97 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  24.3 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  28.85 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2405  hypothetical protein  39.02 
 
 		 84 aa  52  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000012248  hitchhiker  0.00954272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0606  protein of unknown function DUF296  25.95 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.204096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  29.1 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  29.84 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  24.8 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  26.87 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  24.8 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  22.56 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  25.48 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  24.84 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.78 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  29.29 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>