58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0052 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  279  9e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  51.8 
 
 
140 aa  155  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.5 
 
 
135 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  32.61 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  32.61 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  32.33 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  29.55 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  31.88 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  31.34 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  28.87 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  27.69 
 
 
139 aa  77  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  27.91 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  30.66 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  25.58 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  31.2 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  33.87 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  26.72 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  27.91 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  28.79 
 
 
147 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  27.14 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  24.62 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  28.46 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  28.12 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  36.11 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  26.12 
 
 
147 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  25.19 
 
 
173 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  36.36 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  28.47 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  30.88 
 
 
223 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  29.84 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  30.43 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  29.71 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  30.65 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  29.84 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  29.84 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  27.91 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  33.67 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  33.67 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  26.12 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  26.12 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  26.12 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.93 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4429  protein of unknown function DUF296  26.87 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0238348  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  28.35 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  26.12 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3577  hypothetical protein  27.13 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.725686 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09621  glutaredoxin-like protein  40.98 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410142 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  25.78 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  23.2 
 
 
130 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0027  hypothetical protein  32.43 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784882  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  24.82 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  25.23 
 
 
200 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>