49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1618 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  100 
 
 
141 aa  287  4e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  60.28 
 
 
140 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  56.12 
 
 
139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  56.12 
 
 
139 aa  152  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  53.24 
 
 
139 aa  147  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  38.85 
 
 
140 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  42.14 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  36.88 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  35.77 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  38.17 
 
 
135 aa  90.1  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  34.27 
 
 
142 aa  88.2  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  38.46 
 
 
154 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  35.25 
 
 
146 aa  83.6  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  31.15 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  34.06 
 
 
149 aa  77  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  33.78 
 
 
147 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  30 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  28.46 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  31 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  30.6 
 
 
135 aa  57.4  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  28 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  28 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  28.79 
 
 
161 aa  55.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  28.47 
 
 
173 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  31.78 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  27.03 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  26.79 
 
 
156 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  32.08 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  28.37 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  28.37 
 
 
143 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  28.78 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  28.78 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  30.16 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  27.59 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  26.35 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  26.17 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  29.2 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  28.78 
 
 
169 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  26.96 
 
 
158 aa  40  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>