61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1086 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  318  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  64.1 
 
 
158 aa  200  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  62.82 
 
 
158 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  30.87 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  30.82 
 
 
148 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  35.2 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  35.2 
 
 
140 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  32.33 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  27.81 
 
 
143 aa  58.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  28.24 
 
 
147 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  30.22 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  32.21 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  27.61 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08631  glutaredoxin  31.68 
 
 
203 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0632842  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0807  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  32.17 
 
 
223 aa  55.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  34.01 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  25.47 
 
 
168 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  30 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  28.47 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  28.19 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07821  glutaredoxin  30.69 
 
 
203 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0621903  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08601  glutaredoxin  30.69 
 
 
203 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  29.06 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  31.3 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  26.87 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  27.34 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  29.23 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  29.51 
 
 
147 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  26.87 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  26.12 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  24.46 
 
 
201 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  26.87 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  26.79 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  29.92 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  26.02 
 
 
147 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2208  hypothetical protein  29.13 
 
 
130 aa  44.7  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.588439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  23.97 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3997  hypothetical protein  32.5 
 
 
134 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.204392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  25.35 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  29.52 
 
 
200 aa  44.3  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  28.47 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  27.69 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  26.83 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  26.83 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  26.83 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  26.83 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  26.83 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  25.2 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  27.14 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  26.09 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  28.57 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  29.61 
 
 
147 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  29.58 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  29.58 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  26.4 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  29.58 
 
 
133 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  25.19 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  28.57 
 
 
137 aa  40.8  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>