27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0664 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  71.43 
 
 
147 aa  222  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  70.07 
 
 
147 aa  217  5e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  65.99 
 
 
174 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  66.21 
 
 
148 aa  208  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  65.31 
 
 
147 aa  202  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  63.95 
 
 
147 aa  195  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  58.5 
 
 
161 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  48.97 
 
 
168 aa  133  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  44.9 
 
 
147 aa  131  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  46.58 
 
 
147 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  43.15 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  33.79 
 
 
145 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  38.36 
 
 
144 aa  90.9  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  38.03 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  35.92 
 
 
147 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  37.93 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  34.72 
 
 
193 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  34.92 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  27.66 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  29.73 
 
 
143 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  26.21 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  25.5 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  25.5 
 
 
158 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  29.03 
 
 
137 aa  43.5  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>