23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2445 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  100 
 
 
193 aa  385  1e-106  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  54.86 
 
 
149 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  40.85 
 
 
145 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  37.41 
 
 
151 aa  111  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  35.88 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  35.97 
 
 
147 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  37.76 
 
 
147 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  102  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  101  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  37.5 
 
 
161 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  34.03 
 
 
174 aa  94  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  36.17 
 
 
144 aa  93.2  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  32.62 
 
 
148 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  36.11 
 
 
147 aa  88.6  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  35.42 
 
 
147 aa  88.2  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  34.72 
 
 
147 aa  86.7  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  86.3  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  34.93 
 
 
147 aa  85.5  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  33.58 
 
 
168 aa  82  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  35.14 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  32.89 
 
 
148 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0204  protein of unknown function DUF296  26.36 
 
 
146 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.021893  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  23.91 
 
 
137 aa  41.2  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>