31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1557 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  71.72 
 
 		 147 aa  229  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  68.49 
 
 		 147 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0664  hypothetical protein  66.21 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0542269 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  66.21 
 
 		 147 aa  208  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0907  hypothetical protein  65.52 
 
 		 174 aa  206  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1659  hypothetical protein  63.45 
 
 		 147 aa  200  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.417776  normal  0.2077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1586  hypothetical protein  60 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.3614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1125  hypothetical protein  48.28 
 
 		 168 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0493  DNA-binding protein  47.59 
 
 		 147 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00114276  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1504  hypothetical protein  45.27 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1622  hypothetical protein  45.27 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1368  DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding-like protein  43.92 
 
 		 147 aa  120  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3065  hypothetical protein  36.05 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000343127  decreased coverage  0.0000000625124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2267  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 148 aa  87.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2807  hypothetical protein  38.1 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.295564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1685  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.603944  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2445  DNA-binding protein  32.89 
 
 		 193 aa  77  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2848  hypothetical protein  34.46 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0331017  normal  0.0138048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000605413  normal  0.186989 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  30.82 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  26.24 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3860  protein of unknown function DUF296  26.76 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3945  protein of unknown function DUF296  26.76 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000605525 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  26.9 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  31.19 
 
 		 183 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  26.17 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  25.71 
 
 		 137 aa  41.2  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  28.47 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>