15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5673 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  49.43 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  28.14 
 
 		 285 aa  71.2  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  31.4 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  34.62 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  28.82 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  29.79 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  28.92 
 
 		 284 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  30.18 
 
 		 289 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  28.07 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  27.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  27.98 
 
 		 285 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1653  hypothetical protein  31.19 
 
 		 147 aa  44.7  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  28.57 
 
 		 293 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1557  hypothetical protein  31.19 
 
 		 148 aa  42  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>