15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2374 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  45.3 
 
 		 285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  45.1 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  43.51 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  37.85 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  38.54 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  34.95 
 
 		 297 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  34.69 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  35.92 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  29.97 
 
 		 285 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  32.99 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  29.79 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  23.94 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  33.02 
 
 		 130 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>