15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1436 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  579  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  42.05 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  42.86 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  39.57 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  37.94 
 
 		 285 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  37.85 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  35.92 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  36.2 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  35.04 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  32.39 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  32.86 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  29.34 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  28.92 
 
 		 183 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5672  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  29.46 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>