16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5365 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  75.6 
 
 
293 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  47.69 
 
 
290 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  46.09 
 
 
285 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  45.1 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  42.86 
 
 
284 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  42.45 
 
 
295 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  38.1 
 
 
297 aa  172  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  40.94 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  42.17 
 
 
283 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  36.4 
 
 
285 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5672  hypothetical protein  43.4 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  38.84 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  29.14 
 
 
184 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  30.18 
 
 
183 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  25.86 
 
 
147 aa  42.7  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>