17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4388 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  567  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  45.94 
 
 		 290 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  45.3 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  46.09 
 
 		 289 aa  201  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  39.79 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  42.05 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  37.94 
 
 		 284 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  37.05 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  35.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  37.5 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  30.96 
 
 		 285 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  38.39 
 
 		 130 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5672  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  27.71 
 
 		 184 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  32.94 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  27.98 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  32.88 
 
 		 146 aa  42.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>