15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3073 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  49.43 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  31.49 
 
 		 290 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  31.33 
 
 		 297 aa  65.5  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  29.34 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  23.94 
 
 		 289 aa  54.3  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  30.86 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  30.52 
 
 		 150 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  29.14 
 
 		 289 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  27.71 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  23.21 
 
 		 283 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  28.65 
 
 		 295 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2107  protein of unknown function DUF296  25.32 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.971828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  31.51 
 
 		 146 aa  42.4  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0790  hypothetical protein  26.97 
 
 		 147 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>