16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3907 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  47.69 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  45.94 
 
 
285 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  45.16 
 
 
293 aa  203  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  38.54 
 
 
289 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  35.92 
 
 
284 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  35.31 
 
 
295 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  31.67 
 
 
297 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  33.81 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  35 
 
 
275 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  32.19 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  31.49 
 
 
184 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  32.14 
 
 
130 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5672  hypothetical protein  33.93 
 
 
133 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  28.82 
 
 
183 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  31.88 
 
 
146 aa  42.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>