15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6077 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_6077  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5365  hypothetical protein  76.29 
 
 
289 aa  425  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.124702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3907  hypothetical protein  45.16 
 
 
290 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1436  hypothetical protein  39.93 
 
 
284 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878588  hitchhiker  0.0000170273 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2374  hypothetical protein  43.89 
 
 
289 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  43.11 
 
 
285 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4821  hypothetical protein  41.01 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.619327  normal  0.458866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3081  hypothetical protein  36.52 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3647  hypothetical protein  39.93 
 
 
295 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.149375 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6080  hypothetical protein  39.55 
 
 
285 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3612  hypothetical protein  35 
 
 
297 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5672  hypothetical protein  41.51 
 
 
133 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3072  hypothetical protein  37.74 
 
 
130 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.49462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3073  hypothetical protein  31.07 
 
 
184 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.730608  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5673  hypothetical protein  29.05 
 
 
183 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>